1、功能不同：收据主要用于行政事业性收入，是企事业单位在经济活动中使用的原始凭证。发票是会计核算的原始依据，也是审计机关、税务机关执法检查的重要依据。2、作用不同：收据是收付款凭证，发票只能证明业务发生，不能证明款项是否收付。3、特点不同：对于公司，发票主要是公司做账的依据，同时也是缴税的费用凭证；对于员工，发票主要是用来报销。收据也是一种收付款凭证，但它能否入账，要看收据的种类及使用范围。
收款收据分为内部收据和外部收据。而外部收据则根据监制单位的不同，可以分为财政部门监制、部队监制和税务部门监制三种。普通发票可分为三种，即存根联、发票联和记账联。发票和收款收据都是在收付款项时开具的凭证。
注意事项：发票和收据能不能同时开具。因为发票是经营活动的原始凭证，这既是买方的支出证明，同时也是卖方收入证明，是单位和个人生产经营会计核算的重要凭证。收据仅适用于与经营无关的往来款项的凭证。如果要进入成本费用的，必须是发票。
如果收据入成本费用的话，税务部门查到后，要调整增加应纳税所得额征收企业所得税。销货方使用电子计算机开具发票，须经主管税务机关批准，并使用税务机关统一监制的机外发票，开具后的存根联要按照顺序号装订成册。
