本质的区别在于，结构性存款依旧是存款范围，而理财产品不属于存款的范围，也就是说理财产品是有本金亏损的风险在，而存款则一般不会有。结构性存款的门槛相对较高，一般五万元起投，也有部分银行推出一万起投的。而理财产品一般没有什么门槛，像证券投资联接基金10元就能起投。结构性存款的收益往往没有理财产品的收益大。
结构性存款，是指投资者将合法持有的人民币或外币资金存放在银行，由银行通过在普通存款的基础上嵌入金融衍生工具（包括但不限于远期、掉期、期权或期货等），将投资者收益与利率、汇率、股票价格、商品价格、信用、指数及其他金融类或非金融类标的物挂钩的具有一定风险的金融产品。
事实上，结构性存款不是普通存款，也不同于银行理财。结构性存款在存款的基础上嵌入金融衍生工具，通过与利率、汇率、指数等的波动挂钩，使存款人在承担一定风险的基础上获得更高收益。
理财产品，即由商业银行和正规金融机构自行设计并发行的产品，将募集到的资金根据产品合同约定投入相关金融市场及购买相关金融产品，获取投资收益后，根据合同约定分配给投资人的一类产品。
